Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP1P29466 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms