Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNB1P20700 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms