Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP2A2P16615 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms