Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLTBP09497 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLTBP09497 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLTBP09497 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLTBP09497 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLTBP09497 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CLTBP09497 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLTBP09497 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTBP09497 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTBP09497 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTBP09497 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTBP09497 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTBP09497 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTBP09497 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTBP09497 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTBP09497 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTBP09497 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTBP09497 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CLTBP09497 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTBP09497 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTBP09497 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTBP09497 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTBP09497 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLTBP09497 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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