Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEBLO76041 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEBLO76041 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEBLO76041 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEBLO76041 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEBLO76041 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEBLO76041 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEBLO76041 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms