Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVV-1B6SEH8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms