Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms