Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VWA8A3KMH1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VWA8A3KMH1 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms