Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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