Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HDGFL3Q9Y3E1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HDGFL3Q9Y3E1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HDGFL3Q9Y3E1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HDGFL3Q9Y3E1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HDGFL3Q9Y3E1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HDGFL3Q9Y3E1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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HDGFL3Q9Y3E1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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HDGFL3Q9Y3E1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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