Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DKK2Q9UBU2 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DKK2Q9UBU2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms