Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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