Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MBD5Q9P267 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MBD5Q9P267 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms