Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88CQ9P219 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CCDC88CQ9P219 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCDC88CQ9P219 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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