Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UBE2OQ9C0C9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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UBE2OQ9C0C9 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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UBE2OQ9C0C9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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UBE2OQ9C0C9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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UBE2OQ9C0C9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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UBE2OQ9C0C9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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UBE2OQ9C0C9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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UBE2OQ9C0C9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2OQ9C0C9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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