Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CIPCQ9C0C6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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