Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NLRP1Q9C000 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms