Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RNF185Q96GF1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms