Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PHF3Q92576 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PHF3Q92576 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PHF3Q92576 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PHF3Q92576 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PHF3Q92576 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PHF3Q92576 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PHF3Q92576 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PHF3Q92576 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHF3Q92576 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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