Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN4Q92575 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms