Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC12Q8WUD4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms