Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MCOLN3Q8TDD5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms