Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
APCDD1LQ8NCL9 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms