Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC33Q8N5R6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC33Q8N5R6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms