Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC84Q86UT8 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms