Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APTXQ7Z2E3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms