Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CCBE1Q6UXH8 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CCBE1Q6UXH8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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