Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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