Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC142Q17RM4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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