Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LTC4SQ16873 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LTC4SQ16873 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 347.2 ms