Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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