Protein–RNA interactions for Protein: Q14CW9

ATXN7L3, Ataxin-7-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3Q14CW9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATXN7L3Q14CW9 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATXN7L3Q14CW9 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATXN7L3Q14CW9 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATXN7L3Q14CW9 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ATXN7L3Q14CW9 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ATXN7L3Q14CW9 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms