Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NBR1Q14596 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms