Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CUL4BQ13620 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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