Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TDGQ13569 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TDGQ13569 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TDGQ13569 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms