Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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