Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRN3Q13033 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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STRN3Q13033 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRN3Q13033 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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