Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 C17orf80-201ENST00000255557 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AL031714.1-201ENST00000567829 2926 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 DBH-202ENST00000393056 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms