Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOS1Q07889 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOS1Q07889 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SOS1Q07889 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOS1Q07889 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms