Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
OC90Q02509 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
OC90Q02509 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OC90Q02509 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms