Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APBA1Q02410 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms