Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTUD4Q01804 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTUD4Q01804 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTUD4Q01804 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTUD4Q01804 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms