Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DEFA6Q01524 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms