Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3AP98173 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms