Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MCCD1P59942 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MCCD1P59942 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms