Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CLDN15P56746 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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CLDN15P56746 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CLDN15P56746 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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