Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EPHB1P54762 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms