Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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