Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NMUP48645 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NMUP48645 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NMUP48645 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NMUP48645 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NMUP48645 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NMUP48645 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NMUP48645 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
NMUP48645 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
NMUP48645 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NMUP48645 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NMUP48645 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NMUP48645 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NMUP48645 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NMUP48645 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NMUP48645 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NMUP48645 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NMUP48645 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NMUP48645 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NMUP48645 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NMUP48645 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NMUP48645 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NMUP48645 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NMUP48645 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms