Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLCP48506 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms